ĐA DẠNG DI TRUYỀN QUẦN THỂ CÁ CHÌNH HOA (Anguilla marmorata) TẠI QUẢNG TRỊ
Tập 131 Số 1C (2022), Nghiên cứu
Tập 131 Số 1C (2022)

ĐA DẠNG DI TRUYỀN QUẦN THỂ CÁ CHÌNH HOA (Anguilla marmorata) TẠI QUẢNG TRỊ

Nghiên cứu
https://doi.org/10.26459/hueunijns.v131i1C.6615
Đã xuất bản 2022-09-30
Nguyễn Anh Tuấn*
Trường Đại học Nông Lâm, Đại học Huế, 102 Phùng Hưng, Huế, Việt Nam
Đức Nghĩa Võ
Trường Đại học Nông Lâm, Đại học Huế, 102 Phùng Hưng, Huế, Việt Nam
Trần Thị Thuý Hằng
Trường Đại học Nông Lâm, Đại học Huế, 102 Phùng Hưng, Huế, Việt Nam
Đào Tấn Học
Viện Hải Dương Học Việt Nam, 01 Cầu Đá, Nha Trang, Việt Nam
Đặng Thanh Long
Viện Công Nghệ Sinh Học, Đại học Huế, Tỉnh Lộ 10, Huế, Việt nam
PDF

Từ khóa

mitochondrial control region
giant mottled eels vùng gene điều khiển
chình hoa

Cách trích dẫn

1.
Nguyễn AT, Võ Đức N, Trần TTH, Đào TH, Đặng TL. ĐA DẠNG DI TRUYỀN QUẦN THỂ CÁ CHÌNH HOA (Anguilla marmorata) TẠI QUẢNG TRỊ. hueuni-jns [Internet]. 30 Tháng Chín 2022 [cited 22 Tháng Bảy 2024];131(1C):115-23. Available at: https://jos.hueuni.edu.vn/index.php/hujos-ns/article/view/6615
##plugins.generic.citationStyleLanguage.style.acm-sig-proceedings## ##plugins.generic.citationStyleLanguage.style.acs-nano## ##plugins.generic.citationStyleLanguage.style.apa## ##plugins.generic.citationStyleLanguage.style.associacao-brasileira-de-normas-tecnicas## ##plugins.generic.citationStyleLanguage.style.chicago-author-date## ##plugins.generic.citationStyleLanguage.style.harvard-cite-them-right## ##plugins.generic.citationStyleLanguage.style.ieee## ##plugins.generic.citationStyleLanguage.style.modern-language-association## ##plugins.generic.citationStyleLanguage.style.turabian-fullnote-bibliography## ##plugins.generic.citationStyleLanguage.style.vancouver##

Tải trích dẫn

##plugins.generic.citationStyleLanguage.download.ris## ##plugins.generic.citationStyleLanguage.download.bibtex##
Crossref
Scopus
Google Scholar
Europe PMC

Tóm tắt

Nghiên cứu này được thực hiện nhằm đánh giá đa dạng di truyền của quần thể cá Chình hoa (Anguilla marmorata) tự nhiên tại tỉnh Quảng Trị dựa trên việc so sánh trình tự DNA của vùng gene điều khiển CR (control region) ty thể với các quần thể cá Chình hoa trên thế giới. Kết quả cho thấy khoảng cách di truyền giữa các cá thể trong quần thể dao động từ 0 đến 0,261, đạt trung bình 0,024. Trong 31 cá thể, 203 vị trí đa hình tách biệt (S) đã tạo ra 209 vị trí đột biến (Eta) với 31 kiểu haplotype khác nhau. Số lượng các nucleotide khác biệt trung bình là 29.299 (k); hệ số đa dạng nucleotide chiếm 26,09 × 10–3 (Pi); số lượng tối thiểu để xẩy ra quá trình tái tổ hợp (Rm) trong quần thể tương ứng với 51 sự kiện. Phần lớn cá thể thu được tại Quảng Trị có quan hệ di truyền gần gũi với quần thể cá Chình hoa Bắc Thái Bình Dương (27/31 cá thể) và 4 cá thể có mối quan hệ di truyền gần gũi với quần thể Nam Thái Bình Dương. Việc phát hiện các cá thể Chình hoa tại Quảng Trị có di truyền gần gũi với các cá thể thuộc Nam Thái Bình Dương được xem như một điểm đáng chú ý trong nghiên cứu này.

https://doi.org/10.26459/hueunijns.v131i1C.6615
PDF

Tài liệu tham khảo

  1. Ege V. A revision of the genus Auguilla SHAW, a systematic, phylogenetic and geographical study. Dana Report. 1939;16:1-256.
  2. Watanabe S. Taxonomy of the Freshwater Eels, Genus Anguilla Schrank, 1798. In: Aida K, Tsukamoto K, Yamauchi K, editors. Eel Biology. Tokyo: Springer Japan; 2003. p. 3-18.
  3. IUCN. The IUCN red list of threatened species. Version 2014.3 [Internet]; 2014 [cited17 Nov 2015]. Available from: http://www.iucnredlist.org/
  4. Jacoby DM, Casselman JM, Crook V, DeLucia MB, Ahn H, Kaifu K, et al. Synergistic patterns of threat and the challenges facing global anguillid eel conservation. Global Ecology Conservation. 2015;4:321-333.
  5. Crook V. Slipping away: International Anguilla eel trade and the role of the Philippines. Cambridge: TRAFFIC International and ZSL; 2014. p. 24-30.
  6. Jansen HM, Winter HV, Bruijs MC, Polman HJ. Just go with the flow? Route selection and mortality during downstream migration of silver eels in relation to river discharge. ICES Journal of Marine Science. 2007;64:1437-1443.
  7. Pacariz S, Westerberg H, Björk G. Climate change and passive transport of European eel larvae. Ecology Freshwater Fish. 2013;23:86-94.
  8. Fazio G, Sasal P, Mouahid G, Lecomte-Finiger R, Moné H. Swim bladder nematodes (Anguillicoloides crassus) disturb silvering in European eels (Anguilla anguilla). Journal of Parasitology. 2012;98:695-705.
  9. Wahlberg M, Westerberg H, Aarestrup K, Feunteun E, Gargan P, Righton D. Evidence of marine mammal predation of the European eel (Anguilla anguilla L.) on its marine migration. Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers 2014;86:32-38.
  10. Robinet TT, Feunteun EE. Sublethal effects of exposure to chemical compounds: a cause for the decline in Atlantic eels?. Ecotoxicology. 2002;11:265-277.
  11. Faulks LK, Kerezsy A, Unmack PJ, Johnson JB, Hughes JM. Going, going, gone? Loss of genetic diversity in two critically endangered Australian freshwater fishes, Scaturiginichthys vermeilipinnis and Chlamydogobius squamigenus, from Great Artesian Basin springs at Edgbaston, Queensland, Australia. Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems. 2017;27(1):39-50.
  12. Nguyen AT, Tsukamoto K, Lokman PM. Composition and distribution of freshwater eels Anguilla spp. in Vietnam. Fisheries Science. 2018;84(6):987-94.
  13. Petit RJ, El Mousadik A, Pons O. Identifying populations for conservation on the basis of genetic markers. Conservation biology. 1998;12(4):844-855.
  14. Borrell YJ, Piñera JA, Sánchez Prado JA, Blanco G. Mitochondrial DNA and microsatellite genetic differentiation in the European anchovy Engraulis encrasicolus L. ICES Journal of Marine Science. 2012;69(8):1357-1371.
  15. Semeraro F, Cancarini A, dell’Omo R, Rezzola S, Romano RM, Costagliola C. Diabetic retinopathy: vascular and inflammatory disease. Journal of Diabetes Research 2015;58:20-60.
  16. Adamkewicz S, Harasewych M. Systematics and biogeography of the genus Donax (Bivalvia: Donacidae) in eastern North America. American Malacological Bulletin. 1996;13(1):97-103.
  17. Thompson JD, Gibson TJ, Plewniak F, Jeanmougin F, Higgins DG. The CLUSTAL_X Windows Interface: Flexible Strategies for Multiple Sequence Alignment Aided by Quality Analysis Tools. Nucleic Acids Research. 1997;25(24):4876-82.
  18. Hall TA. BIOEDIT: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/ NT. Nucleic Acids Symposium Series. 1999;41:95-98.
  19. Nei M, Kumar S. Molecular Evolution and Phylogenetics. New York: Oxford University Press; 2000.
  20. Rozas J, Ferrer-Mata A, Sánchez-DelBarrio JC, Guirao-Rico S, Librado P, Ramos-Onsins SE, et al. DnaSP 6: DNA Sequence Polymorphism Analysis of Large Data Sets. Molecular Biology and Evolution. 2017;34(12):3299-302.
  21. Kumar S, Stecher G, Li M, Knyaz C, Tamura K. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across Computing Platforms. Molecular Biology and Evolution. 2018;35(6):1547-1549.
  22. Minegishi Y, Aoyama J, Tsukamoto K. Multiple population structure of the giant mottled eel, Anguilla marmorata. Molecular Ecology. 2008;17: 3109-3122.
  23. Moritz C, Dowling TE, Brown WM. Evolution of animal mitochondrial DNA: relevance for population biology and systematics. Annual Review of Ecology and Systematics. 1987;18:269-292.
  24. Stoneking M, Hedgecock D, Higuchi RG, Vigilant L, Erlich HA. Population variation of human mtDNA control region sequences detected by enzymatic amplification and sequencespecific oligonucleotide probes. American Journal of Human Genetics. 1991; 48:370-382.
  25. Avise JC. Molecular Markers, Natural History, and Evolution, 2nd edn. Massachusetts: Sinauer & Associates, Sunderland; 2004.
  26. Ishikawa S, Tsukamoto K, Nishida M. Genetic evidence for multiple geographic populations of the giant mottled eel Anguilla marmorata in the Pacific and Indian oceans. Ichthyological Research. 2004; 51(4):343-53
  27. Han Y-S, Yambot AV, Zhang H, Hung C-L. Sympatric Spawning but Allopatric Distribution of Anguilla japonica and Anguilla marmorata: Temperature- and Oceanic Current-Dependent Sieving. PLOS ONE. 2012;7(6):e37484
  28. Tesch FW. The eel: biology and management of anguillid eels, 5th edn. Oxford: Wiley-Blackwell; 2003.
  29. Aoyama J. Life history and evolution of migration in catadromous eels (genus Anguilla). Aqua-BioScience Monographs. 2009;2:1-42.
  30. Kuroki M, Aoyama J, Miller M, Yoshinaga T, Shinoda A, Hagihara S, et al. Sympatric spawning of Anguilla marmorata and Anguilla japonica in the western North Pacifc Ocean. Journal of Fish Biology. 2009;74:1853-1865.
  31. Hu J, Kawamura H, Hong H, Qi Y. A review on the currents in the South China Sea: seasonal circulation, South China Sea warm current and Kuroshio intrusion. Journal of Oceanography. 2000;56:607-624.
  32. Kuroki M, Miller MJ, Feunteun E, Sasal P, Pikering T, Han Y-S, et al. Corrigendum to “Distribution of anguillid leptocephali and possible spawning areas in the South Pacific Ocean” [Progr. Oceanogr. 180 (2020) 102234]. Progress in Oceanography. 2020;183: 102310.
Creative Commons License

công trình này được cấp phép theo Creative Commons Ghi công-Chia sẻ tương tự 4.0 License International .

Bản quyền (c) 2022 Array